Computational Phylogenetics

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Structure du cours

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Cours:
  • définir une hypothèse nulle et alternative
  • pourquoi les statistiques: de la saisie des données à l'analyse
  • comment prendre des mesures en biologie
  • variabilité intra- et inter-observateur
  • répétabilité
  • contrôle et traitements
  • qu'est-ce qu'un bon échantillon et importance d'un bon design expérimental
  • données expérimentales vs observationnelles
  • pseudo-réplication
  • randomisation
  • puissance d'un test: définition et effets
  • quelles données pour quel test? Revue des tests principaux vu au cours de statistiques pour biologistes en illustrant leur utilisation, le type de données permettant d'effectuer ces tests, quelles conséquences sur le résultat du test si les données ne sont pas adéquates, comment s'y prendre pour y remédier
  • test de t vs Wilcoxon
  • anova un facteur vs Kruskall-Wallis
  • régression linéaire
  • Chi-carré
Exercices:
  • utilisation de données biologiques réelles illustrant les notions du cours
  • présentation d'articles scientifiques illustrant les tests abordés
 

Lab News

paper accepted
Fri Dec 14, 2012
Lexer et al. ‘Next generation’ biogeography: towards understanding the drivers of species diversification and persistence. J. Biogeo.
phylo lab
Hélène Morlon
Wed Nov 28, 2012 @12:15 - 01:15PM
Hélène Morlon will give a seminar at the DEE. The title is "Recent developments in phylogenetic approaches to diversification: incorporating ecological and paleoenvironnemental data".
amphitheatre Biophore

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