View source for Genetics of urinary calcium levels

'''Background''': Our research group contributed to show that a particular gene is involved in the regulation of calcium serum.

'''Goal''':  The goal of this project is to use the same methid, namely Genome-Wide Association Studies to find genes involved in the regulation of urinary calcium. 

'''Mathematical tools''': The student will learn the statistics associated with Genome-Wide Association Studies

'''Biological or Medical aspects''': The students will learn how Genome Wide Association Studies can lead to medical discoveries, in particular in the calcium biology

'''Supervisor''':  [[User:Tanguy|Tanguy Corre]]

'''Students''': 


'''Contexte ''': 


'''But''' :
 Identifier les locis du génome qui induisent une variation significative de la concentration en calcium dans l’urine chez les différents individus de l’étude CoLaus. 

'''Aspects biologiques ou médicaux ''': 
La concentration calcique urinaire varie entre individus. Une partie de cette variation peut être déterminé génétiquement. Dans le cadre de cette étude, nous nous somme justement intéressé à la part de variance expliqué notamment par les SNP

'''Outils mathématiques''' : 
Nous avons utilisé le programme Matlab principalement et nous nous somme également aidé du programme R


'''Matériel et méthodes''' :


'''Résultats principaux''' :

Lors de l'analyse d'association sur tout le génome, nous avons trouvé 4 gènes intéressants. Ces derniers sont regroupé dans un tableau qui se trouve ci-dessous. Le seuil de significativité varie entre 10-5 et 10-8 selon les cas. Nous Avons ajusté le seuil afin d'avoir un minimum de faux négatif. 

[[File:Capture_d’écran_2014-05-29_à_21.58.17.png|thumb|500px]]



'''Conclusions ''':