Difference between revisions of "Genetics of urinary calcium levels"
Sbprm2014 3 (talk | contribs) |
Sbprm2014 3 (talk | contribs) |
||
| Line 15: | Line 15: | ||
| − | '''But''' : | + | '''But''' : Identifier les locis du génome qui induisent une variation significative de la concentration en calcium dans l’urine chez les différents individus de l’étude CoLaus |
| − | |||
| − | '''Aspects biologiques ou médicaux ''': | + | '''Aspects biologiques ou médicaux ''': La concentration calcique urinaire varie entre individus. Une partie de cette variation peut être déterminé génétiquement. Dans le cadre de cette étude, nous nous somme justement intéressé à la part de variance expliqué notamment par les SNP |
| − | La concentration calcique urinaire varie entre individus. Une partie de cette variation peut être déterminé génétiquement. Dans le cadre de cette étude, nous nous somme justement intéressé à la part de variance expliqué notamment par les SNP | ||
'''Outils mathématiques''' : | '''Outils mathématiques''' : | ||
Revision as of 22:13, 29 May 2014
Background: Our research group contributed to show that a particular gene is involved in the regulation of calcium serum.
Goal: The goal of this project is to use the same methid, namely Genome-Wide Association Studies to find genes involved in the regulation of urinary calcium.
Mathematical tools: The student will learn the statistics associated with Genome-Wide Association Studies
Biological or Medical aspects: The students will learn how Genome Wide Association Studies can lead to medical discoveries, in particular in the calcium biology
Supervisor: Tanguy Corre
Students:
Contexte :
But : Identifier les locis du génome qui induisent une variation significative de la concentration en calcium dans l’urine chez les différents individus de l’étude CoLaus
Aspects biologiques ou médicaux : La concentration calcique urinaire varie entre individus. Une partie de cette variation peut être déterminé génétiquement. Dans le cadre de cette étude, nous nous somme justement intéressé à la part de variance expliqué notamment par les SNP
Outils mathématiques : Nous avons utilisé le programme Matlab principalement et nous nous somme également aidé du programme R
Matériel et méthodes :
Résultats principaux :
Lors de l'analyse d'association sur tout le génome, nous avons trouvé des SNP sur 4 gènes intéressants. Ces derniers sont regroupé dans un tableau qui se trouve ci-dessous. Le seuil de significativité varie entre 10-5 et 10-8 selon les cas. Nous Avons ajusté le seuil afin d'avoir un minimum de faux négatif.
Conclusions :
